新潟県スイミングクラブ協会は独自の事業を進める中で、新潟水泳協会とは強い協力関係を結びながら、合同合宿、合同練習会、競技会の共同開催を行っています。

中でも１月のＪＳＣＡ新年フェスティバル、４月の新潟県ＳＣ協マスターズ大会の運営は新潟水泳協会本部、レディス部の協力の下で成立しています。